Сътрудничеството с учени по компютърни науки в облачна среда е задължително по пътя към значителните пробиви, които виждаме днес. Но на практика учените са принудени да инвестират много време в работата на облачната среда във всичко, свързано с достъп до големи данни, събиране и изтегляне на изчислителни машини, справяне със софтуерните изисквания, запазване на предавания и др. Израелският стартъп Code Ocean смята, че има решение на този проблем и вчера (сряда) обяви нова инвестиция, получена от Microsoft.
Проблем със сътрудничеството между изследователите
Идеята за създаване на Ocean Code дойде след докторския опит на Саймън Адар (един от основателите) в университета в Тел Авив; там той си сътрудничи с Германската космическа агенция и изследователски лаборатории в Европа. „Централна част от проекта беше необходимото сътрудничество между различните центрове“, казва Адар. „Всяка изследователска лаборатория беше лидер в своята област. Някои бяха световни лидери в изчислителното обучение, други в геоложките модели, някои в геометричните изчисления и т.н. Но всъщност не успяхме да прехвърлим изчислителната инфраструктура от една лаборатория в друга, за да я използваме от всички участващи бързо и лесно. В действителност всяка лаборатория работеше главно изолирано. Сътрудничеството по същество беше ограничено до просто компилиране на различни глави в един документ." Но Code Ocean има решение: да се разработи инфраструктура за компютърна наука, която може лесно да се споделя с връзка, независимо от размера на информацията, колко сложна е средата по отношение на инсталираните софтуерни изисквания и колко изчислителна мощност е необходима.
В разговор с Geektime Саймън Адар, съосновател и главен изпълнителен директор на компанията, казва, че компанията е избрала да направи това с помощта на Docker за разширение на контейнери. Това е нов контейнер за изчислителна наука, който съдържа всичко необходимо за възпроизвеждане на научни експерименти с помощта на изчисления. Кодът, информацията и изчислителната среда. „Технологията се нарича Compute Capsule и съдържа кода, информацията и изчислителната среда. Технологията позволява на учения да се концентрира върху самата научна работа, а не върху всичко, което заобикаля работата на облачната среда.“
Платформата Ocean Code работи на две нива: първото е за частна употреба от компании и изследователски институти; вторият е за обществеността – включва 2500 публични изследователски капсули, достъпни в отворен код, където изследователите споделят знания с глобалната общност. Компанията казва, че биофармацевтични компании като Sema4, Lantern, Champions Oncology, CytoReason, Dragonfly Therapeutics вече използват нейния продукт.
Днес учени и изследователи могат да използват езици и инструменти с отворен код като Jupyter Notebook или RStudio. Какво отличава Code Ocean?
„Тази връзка изисква много разработки или ръчни операции, които са твърде сложни за един учен. Те са много разочароващи и отнемат време. Повечето учени нямат уменията или желанието да се справят с тези подробности. Ocean Code е първата виртуална лаборатория за компютърни науки. Нашата компания има продукт, който е отворен и безплатен за научната общност и е свързан с известни научни издания като Nature и Enterprise– за компании с изследователски отдели. Днес ние сме много фокусирани върху света на биотехнологиите, който се занимава с голям анализ на геномна информация."
Code Ocean е основана от Саймън Адар (главен изпълнителен директор) и Верам Даян (вицепрезидент по технологиите – който вече е продал компания на Harman (сега Samsung). В нея работят 35 души, повечето от които в центъра за разработка в Тел Авив Настоящият кръг от финансиране от 16,5 милиона долара беше воден от фонда M12 на Microsoft и Battery Ventures и поставя общия набран капитал на компанията до момента на 37,5 милиона долара.
