En juillet 2021, l'éditeur de biomédical et de vie en libre accès, Elife, a commencé une nouvelle approche des soumissions d'articles: il ne fera que passer en revue les manuscrits qui ont déjà été publiés sous forme de préparation.Parallèlement à cela, le processus éditorial de l'éditeur s'est concentré sur la production de critiques publiques qui sont publiées aux côtés des préparations.
Une telle décision est une indication de la façon dont les préparations - les versions des articles avant d'avoir été examinées ou modifiées par des pairs - sont devenues plus centrales à l'ensemble du processus de communication savante au cours des dernières années.
Comme l'a expliqué Damian Pattinson, directrice exécutive d'Elife: «[Préprints] jouent un rôle très central dans l'ensemble de notre processus d'examen et nous sommes impatients de les rendre plus centraux.Pour nous, ils sont une occasion incroyable de changer le système et d'apporter la façon dont la recherche est communiquée à une époque entièrement numérique.Le rôle que nous voyons Elife jouer à long terme est celui où nous ne sommes essentiellement qu'une organisation de révision pour la recherche déjà publiée.'
Les chercheurs dans de nombreux domaines de mathématiques, d'informatique et de physique ont entretenu une relation étroite avec des préimprimés pendant plusieurs décennies et des processus comme Elife ont récemment adopté ne sont pas nouveaux pour eux (voir Box pour certaines réflexions de l'astrophysicien basé en Australie, Richard de Grijs).Cependant, ce sont des crises de santé publique récentes qui ont vraiment propulsé la pratique du partage de préimpréries dans le courant dominant à travers d'autres disciplines.
La mise à disposition des résultats de la recherche scientifique permet rapidement à d'autres scientifiques de s'appuyer sur ces résultats.Cela signifie également que les décideurs peuvent utiliser les résultats pour développer des politiques.
Michele Avissar-Whiting, rédactrice en chef de Preprint Server Research Square, a noté que c'était les récentes épidémies de Zika et Ebola qui ont d'abord incité les bailleurs de fonds de la recherche médicale à faire pression pour le partage de préimpréries pour les situations médicales d'urgence.Et cela a été particulièrement utile pour l'avènement de Covid-19 et la nécessité de partager rapidement les résultats sur les symptômes, comment il se propage, la caractérisation du virus et l'émergence de nouvelles variantes.
‘If there's one silver lining to this last couple of years it's been that it forced people's hand on [preprints].Cela aurait été fou si nous adhériez aux délais et aux restrictions autour de la libération des résultats imposés par le système traditionnel.Il aurait été fou d'attendre trois mois, six mois, un an pour publier une séquence. Preprints kind-of saved the day but they also showed that it doesn't need to be an emergency-only protocol.'
Elle a ajouté que les progrès rapides avec les réponses Covid-19, aidés par la disponibilité préimprémit, pourraient être reproduits pour accélérer le processus de compréhension et de recherche de traitements pour d'autres maladies, comme le cancer.
Au-delà de la santé
Le potentiel de partage des préparations va au-delà de l'échange rapide des informations sur la santé, selon Joy Owango, directeur exécutif du Kenya Training Center in Communication (TCC Africa).TCC Africa travaille avec AfricarXiv pour s'assurer que les archives continentales de préparation, qui ont été lancées en 2018 et comprend désormais les soumissions de 33 pays d'Afrique (voir MAP), est durable.
«En ce qui concerne les préimprimés en Afrique, nous envisageons la visibilité de la recherche, la souveraineté des données et la promotion des connaissances autochtones.Tous les éléments de recherche soumis (manuscrits, ensembles de données, ponts de diapositives, rapports de recherche et propositions) obtiennent des identifiants persistants pour établir la priorité de découverte aux auteurs africains.AfricarXiv est ouvert aux soumissions d'articles de recherche dans n'importe quelle langue pertinente pour le continent, y compris SetSwana, Amharic et Igbo, ainsi que toutes les langues de l'Union africaine - français, swahili, arabe, portugais [et].Nous avons enfin une plate-forme qui partage nos résultats de recherche avec le monde, battant l'idée que si la recherche n'est pas en anglais, elle n'est pas accessible.'
AfricArXiv has been well received by researchers, she continued: ‘They are interested in the services the platform offers; it's free for individuals and can be used for research dissemination in a way that is complementing journal publishing with immediate effect for research visibility and reputation building.'
She gave the example of Kenya, where the academic regulatory body, Commission of University Education, made it mandatory for every Masters' and PhD student to publish before they graduate. ‘The staggering fees for article processing charges (APC) at many journals led to an unfortunate rise in predatory journal publishing,' she said.`` Cela vient de monter en flèche, puis le stress de passer par la soumission à l'acceptation - cela peut être de six mois, un an - et si vous finissez par publier dans une revue prédatrice, ce qui entraîne une perte de réputation pour le chercheur et souvent l'affilierinstitution.'
L'utilisation d'archivage préimprémit dans le cadre du processus de soumission du manuscrit à un journal change la donne;Les préimprimés se voient attribuer des identifiants d'objets numériques (DOI), ainsi qu'une licence ouverte aux manuscrits et autres éléments de recherche pour les rendre ciables;et les téléchargements et les citations peuvent être mesurés pour les analyses bibliométriques.Elle ajoute: «Cela donne un niveau de confiance et de facilité aux chercheurs car ils identifient des revues certifiées et abordables potentielles pour publier dans.L'utilisation de serveurs préparatoires dans le processus d'édition, en particulier s'il est lié aux référentiels institutionnels, peut renforcer la relation entre les bibliothécaires et les bureaux de recherche dans les universités.'
Avissar-Whiting agreed about the impact of preprints on researchers: ‘They've introduced researchers to a new way of doing things. One of the main reasons they post the preprint to begin is that they have been toiling away on this research and have really only consulted with the people in their nearby lab group, so they are curious what the world thinks of what they've done and want an honest assessment of it.'
Research Square's users – both authors and readers – are distributed around the world (see map).Mais Avissar-Whiting a observé que les préparations n'ont pas encore été adoptées partout, notant que le partage des préparations n'est pas actuellement une pratique courante dans certains pays.
Pattinson espère que les préimprimés soient adoptés partout: «Pour un système véritablement inclusif, vous avez l'occasion pour tout le monde [dans le monde] de publier leur travail les uns aux autres, puis l'examen et la conservation se produisent, donc ils ont ce terrain de jeu. The opportunity for more inclusive systems is a key driver for why we're doing this, but it is hard.'
At the moment, he explained, ‘the people who post preprints are generally the bigger labs, the more experienced researchers, the people who have more confidence in putting their work out before it's been formally reviewed'.
And researcher behaviour is quite subject specific too, he continued, noting that eLife's authors in more computational fields, such as neuroscience, cell biology and genetic genomics, are more comfortable with posting preprints than other disciplines. ‘eLife is beginning to publish more clinical work and that poses challenges because a lot of clinicians are less aware of preprints and there's more explaining to do.'
Ouvrir la science
Les préimprimés peuvent également jouer un rôle d'accès important.Bien que les préimprimés ne satisferont pas beaucoup, le cas échéant, les mandats modernes en libre accès, ils permettent de lire par quiconque par quiconque et les serveurs de préparation permettent d'être consultables et découvrables.Et ils jouent un rôle plus large dans les sciences ouvertes, ouvrant la voie à une revue ouverte et à apporter de nouvelles idées pour améliorer la qualité de la sortie finale, publiée.
As Pattinson commented: ‘The goal is to have feedback of everything we review and we should be posting that feedback publicly because it's incredibly useful information.Les auteurs ont une nervosité évidente concernant la publication de critiques qui critiquent leur travail mais, dans la pratique, les revues sont très constructives, pas grossiers ou agressifs, mais des commentaires utiles.Nous pensons que les lecteurs bénéficieraient de savoir s'il y a des problèmes qui doivent être résolus sur une préimpression.'
Il est également enthousiaste à propos d'une nouvelle approche d'un examen ouvert émergeant à l'arrière des préparations, en particulier à la suite de Covid-19.«Nous sommes très intéressés par les modèles où les groupes d'universitaires trouvent des articles covidés intéressants et les examinent, puis allez-y et publiez leurs avis sur leurs propres sites Web.Il est vraiment né par nécessité - exactement comment sont les meilleures choses.'
Défis
Malgré l'enthousiasme de beaucoup, il y a également eu beaucoup de mots de critique à propos des préparations.En particulier, la disponibilité prête et rapide des préparations liées au Covid-19 a conduit à une certaine confusion et malentendus, et certaines sceptiques de la vaccination ou de l'existence du virus lui-même en train de cueillir des conclusions scientifiques pour revendiquer l'authenticité à leurs théories.
As Alejandra Arreola Triana, who teaches science communication at Universidad Autónoma de Nuevo León, in Monterrey, Mexico, summed up: ‘As an author's editor, I like the idea of setting precedent and perhaps getting comments or citations.Mais, en tant que personne qui s'est formée au journalisme scientifique, j'ai vu qu'ils ont provoqué de graves malentendus pendant la pandémie.'
Avissar-Whiting a reconnu ces préoccupations: «Chaque plate-forme a eu du mal avec le problème de désinformation et de désinformation et l'a traitée différemment.Nous avons pris la décision de prendre un peu de main lourde.' She explained the approach that Research Square has taken of screening manuscripts, deciding whether to publish the preprints and, if so, whether to work with the authors on producing lay explainer texts.
«Nous pensions que nous devions faire quelque chose et nous avions les ressources en interne pour [le faire].Je pointe toujours le papier de cellules T qui est sorti en juin 2020.Il provenait d'un laboratoire en Allemagne et était l'une des nombreuses études parlant de l'immunité des cellules T et de la façon dont nous avons une certaine immunité de notre exposition aux coronavirus qui provoquent le rhume.C'était un article d'immunologie très complexe, mais les auteurs disent que quelque chose comme 80% d'entre nous a des restes de cette immunité des coronavirus.
‘That paper, if you cherry picked it apart, played into that [Covid hoax] narrative and so that preprint went crazy viral, but it was all within this circle of people saying it's a hoax – an insane take given the whole world was being crushed by sickness.Ce que nous avons fait a été d'écrire un résumé laïque et de le mettre sur la préimpression.Les gens ont commencé à capturer le résumé laïque et à le mettre sur Twitter chaque fois que les gens prendraient cette étude comme preuve de Covid qui n'existait pas. I don't know how much of an impact that had on quelling the confusion around [the research], but I do know people noticed it and used it exactly the way we intended for them to use, as a plain language explanation of what this preprint was talking about.
‘The interesting thing is, the manuscript went on to be published in Nature Immunology and it still got lots of attention from the same [Covid hoax] crowd, so having been peer reviewed doesn't change the fact that people can take information and twist it or misunderstand complicated research.'
Plus largement, cela fait clairement pour expliquer aux lecteurs ce que sont les préimprimés et ne sont pas. ‘We have this disclaimer on our preprints that I think most of the preprint servers have, which says this is a preprint, it's not been peer-reviewed by a journal (you want to be specific as there are other mechanisms for peer review).'
Cependant, elle a ajouté: «Les scientifiques qui trouvent des préimprimés sur les serveurs qui sont spécifiquement liés à leur sujet de terrain sont les experts;Ce sont les personnes qui sont les meilleures pour examiner un papier.Nous voulons qu'ils le regardent et, idéalement, nous voulons qu'ils le commentent et le remettent en revue officiellement.'
Pattinson also observed: ‘Preprint archives are extremely careful about what they post and have professional editors looking at papers to make sure there aren't going to be significant issues.Je pense que peut-être ce bit s'est un peu perdu. Overall, the risk of [dubious studies being shared as preprints] probably isn't much higher than things getting published in journals and slipping through those channels.'
Il voit cependant un autre défi: comment les serveurs préparatoires peuvent indiquer plus clairement si quelque chose a été évalué par des pairs.«Pour le moment, toutes les préparations ont la même clause de non-responsabilité essentiellement - même les articles où les critiques sont clairement affichées aux côtés.En fin de compte, c'est quelque chose que nous aimerions voir s'améliorer à l'avenir.'
Regarder vers l'avenir
Il est clair que les préimprimés font désormais partie du processus de communication savante, mais certains défis demeurent.L'un d'eux est le défi d'une acceptation plus large, qui vient avec le soutien des bailleurs de fonds de recherche et des décideurs.
Comme l'a expliqué Owango, en particulier en ce qui concerne les préimprimés en Afrique: «Avec le temps, nous examinons une situation où les préparations sont considérées comme une production de recherche pour les promotions, et pour que quelqu'un obtienne son diplôme. For that to happen, you're talking at a policy level. It's convincing university education commissions: this is a new technology in academic publishing, this person has already identified or is in the process of identifying their journal and this output is already collecting citations and downloads.'
Regarding funders, Avissar-Whiting noted that ‘some have really taken quite a strong position of requiring preprint deposition and most of the ones that aren't requiring it now have some line in their policies about encouraging the use of preprints and preprint review mechanisms'.Pattinson était d'accord sur le soutien du bailleur de fonds, notant que «les bailleurs de fonds les aiment… Je pense que cela stimulera cette sortie.'
Les développements technologiques joueront également un rôle plus large dans l'acceptation.Déjà, comme l'a souligné Owango, l'utilisation de DOI dans des serveurs préparatoires a permis de permanence et a facilité la cité des préparations.Mais il y a plus qui peut être fait pour utiliser DIS dans les enregistrements de préparation.
Avissar-Whiting a récemment mené des recherches sur des préimprimés d'articles qui ont ensuite été publiés puis rétractés. The number of such examples is still very small, but she says it highlights the importance of knowing what happens with a paper downstream: ‘We'd want to be aware of these things so that we can link them backwards.CrossRef va vraiment vous aider car si une partie crée l'association, théoriquement, les informations peuvent circuler dans les deux sens.'
Il existe également du potentiel pour travailler sur la façon dont les données préimprimées sont structurées, marquées et réutilisées.Une avenue explorée par certains est l'utilisation de l'intelligence artificielle pour les préparations d'exploration de données.Les outils de traduction ouvrent également de nouvelles opportunités, tout comme la possibilité d'incorporer les technologies de la blockchain.
Pattinson note qu'Elife veut explorer des moyens de brouiller les frontières entre les préimprimés et les articles de revues - par exemple, en améliorant le rendu de l'affichage pour rendre les chiffres plus utiles, ayant les types de métadonnées que vous associez à l'article de revue.
‘It is an opportunity to do things better and revise the system,' he summed up.«Tous les déchets qui se produisent dans le système actuel, où tout se fait à huis clos et les avis sont jetés dans le bac chaque fois qu'un papier est rejeté, nous en avons besoin pour aller.Nous considérons les préimpressions véritablement comme [l'une des] innovations les plus excitantes de la science biomédicale depuis 20 ans.'
